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当调用 pubr 的 stat_pvalue_manual 函数时:

ggplot + stat_pvalue_manual(statistics, label = "p.adj.signif", 
                 coord.flip = TRUE,
                 #hide.ns = TRUE, 
                 tip.length = 0,
                 bracket.size = 0)+coord_flip()

生成以下图表: 带有 ns 的 stat_pvalue_manual

然而,人们只对重要的数据感兴趣,因此通过调用 hide.ns = TRUE 来省略 ns 数据,如下所示:

ggplot + stat_pvalue_manual(statistics, label = "p.adj.signif", 
                 coord.flip = TRUE,
                 hide.ns = TRUE, 
                 tip.length = 0,
                 bracket.size = 0)+coord_flip()

这会在 ns 数据先前占用的地方创建空白空间,有没有办法删除它?

没有 ns 的 stat_pvalue_manual

要计算 xy 位置,在统计对象中按如下方式完成:

statistics <- dataframe %>%
tukey_hsd(value~group) %>%
add_xy_position(fun = "mean_se", x= "group")

提前致谢!

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