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基于 biojava,我个人制作并正在使用与 blastN 一起使用的东西。

我在本地使用 v4 的 NR 和 NT DB。但是,更新此 v5 后出现了一个问题。

我尝试使用 BLAST+ 版本 2.11.0 读取和 xml 意大利面文件。(这是用于 Excel 解析。)

它在 v4 的数据库中运行良好,但 v5 没有给我结果。以下是我使用的选项。

[blastn, , -task, megablast,
 -db, db_loc
-query, C:\Users\Cosmos\Desktop\report.fas, 
-num_threads, 4, 
-num_alignments, 10, 
-num_descriptions, 10, 
-out, C:\Users\Cosmos\Desktop\blast.xml,
-outfmt, 5]

有什么我没有检查的吗?我期待您的建议。

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