所以我创建了一棵没有指定分支长度的树，并且我有一个具有完全相同尖端名称的数据集，并且每个物种总共有 5 次测量（450 次测量）。我正在尝试使用这些测量值进行 MLE（最大似然估计）来改变分支长度，但我不确定如何去做。我需要使用所有 5 个，并且我需要的分支长度是样本的直接分支。一个捷径是根据每个样本的 5 个测量值计算出每个样本的 MLE 值，并将其输入到 Mesquites.exe 中，但我所拥有的代码再次让我查看其中一个变量而不是全部5. 我拥有的 5 个变量是 5 种不同的长度测量值，但我需要使用所有这些变量，而不仅仅是一个变量
wingL <- geodata$wingL
MLreconstruction <- ace(wingL, geotree, type="continuous", method="ML")
MLreconstruction
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