r - 有没有办法在 R（Phyr 和 MuMin 包）中挖掘 PGLMM_compare 模型？

Question

我正在进行比较分析，我的响应变量为 0 或 1，因此我需要使用二项式误差分布进行系统发育校正分析。我使用了 phyr 包 ( https://rdrr.io/github/daijiang/phyr/man/pglmm_compare.html ) 中的 PGLMM_compare 函数来创建一个包含所有变量的完整模型，但 MuMin 不支持将此输出作为'全球模式'，因此我无法疏通它。我正在寻找一种方法来找到最好的模型并可能从这些模型中执行模型平均，但是这些包似乎不兼容。手动创建所有模型会很困难，因为我有大约 8 个解释变量。有没有办法疏通具有二项式错误结构的系统发育模型？提前致谢。

Answer 1

You would need to implement at least the following methods for dredge and model.avg to work with pglmm_compare:

nobs.pglmm_compare(object, ...) 
logLik.pglmm_compare(object, ...)
coef.pglmm_compare(object, ...) 
coefTable.pglmm_compare(model, ...)