r - `levels<-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) 中的错误：因子级别 [3] 重复

Question

我正在尝试使用 autoplot 绘制多面生存曲线，但是协变量的组合和对它们进行多面化会在因子内重复水平

library(survival)
library(ggfortify)
fit <- survfit( Surv(time, status) ~ inst + sex,
                 data = lung )

autoplot(fit, facets = TRUE)


Error in `levels<-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) : 
  factor level [3] is duplicated

有没有人用自动绘图成功地绘制了多面生存曲线？我尝试了survminer，但由于协变量占据了大部分情节区域，情节看起来很可怕。

Answer 1

我认为您应该再看一下ggsurvplot，因为autoplot.survfit似乎不喜欢拥有多个自变量（无论您是否分面）。

该ggsurvplot函数返回一个 ggplot 对象，因此您无需满足于默认选项。您可以根据需要添加比例和样式。以您为例，我们可以这样做：

library(survival)
library(ggfortify)
library(survminer)

fit <- survfit( Surv(time, status) ~ inst + sex,
                 data = lung )

p <- ggsurvplot(fit, facet.by = "inst", conf.int = TRUE) + 
  theme(strip.background = element_blank(),
        axis.line.x = element_line())

p$facet <- facet_wrap(.~inst, ncol = 3, nrow = 6, scales = "free")

p