scikit-image - 如何在 Frangi 过滤器中为 DICOM 数据的 3D 堆栈设置间距

Question

我正在使用Frangi 过滤器进行肝血管分割。问题是这些数据不是各向同性的 [1,1,1]。我可以重新采样。它会创建更多切片，但会丢失像素并且不那么精确。

我发现，也许我可以直接在计算 Hessian 函数的脚本中的 Frangi 函数（skimage 函数）中更改它。但即便如此，我也不知道应该将哪些值设置为spacing。

因为现在我有一些结果，但它们不正确，因为我正在计算 z 方向的挤压图像。

谢谢您的帮助。

Answer 1

通过阅读代码，目前不可能对不同的轴使用不同的比例（sigma）——我们假设每个轴使用相同的 sigma。在未来的版本中应该可以改进这一点。您可以在https://github.com/scikit-image/scikit-image/issues/new/创建功能请求。我建议您在创建它时链接回这个问题。