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我在 PyMOL 上上传了 100 多个 pdb 文件,我的任务是对它们进行一些分析。一切都很顺利,直到我被要求为每个结构提取配体并突出显示并将它们表示为一个选定的对象,我可以使用它进行进一步分析。

手动执行此操作,您将单击序列查看器,您可以在其中选择分子上的所有配体。但是,我需要为 100 多个结构执行此操作,所以有没有办法可以自动执行任务?我查看了文档并尝试了几种涉及选择代数的不同方法,但到目前为止似乎没有任何效果。有 PyMOL 经验的人可以帮助我吗?

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