python-3.x - 如何通过python3将多个png或Jpeg图像转换为一个nifti图像？

Question

我有 191 个不同的 png 图像。

如何将它们转换为一张 3d nifti 图像？

Answer 1

这是一个 SimpleITK python 脚本，它可以读取一堆 PNG 图像并输出 3d Nifti 图像：

import SimpleITK as sitk
import glob

file_names = glob.glob('*.png')
reader = sitk.ImageSeriesReader()
reader.SetFileNames(file_names)
vol = reader.Execute()
sitk.WriteImage(vol, 'volume.nii.gz')

该脚本假定glob以正确的顺序获取文件名。此外，创建的 3-d 体积将在 X、Y 和 Z 中具有统一的间距。如果 Z 间距与 X 和 Y 不同，您可以vol.SetSpacing使用任何间距值进行调用。