我想为我的研究使用用于 packmol (MDAPackmol) 的 python 包装器。为此，我尝试使用GitHub 上提供的示例代码和 pdb 文件，以便了解如何使用包装器。但是，当我运行代码时，我收到以下错误消息：ValueError: invalid literal for int() with base 10.
这是完整的追溯：
错误源于start.resname零长度字符串。具有数字和字母的 resname 似乎有问题，因此Universe（返回的对象load_packmol_output）有问题。因此，残留物存在问题。我现在想知道这是否是 MDAnalysis 下载/安装方式的错误或缺少依赖项。任何建议或见解将不胜感激。谢谢！
我无法真正重现您的错误，但让我们从您的堆栈跟踪向后工作。
我们在mdapackmol.py的第 184 行。失败的部分是int(start.resname[1:]). 如果我运行示例代码，则start.resname等于R0，所以start.resname[1:]is'0'和int(start.resname[1:])is 0。
在您的情况下，可能start.resname类似于R，然后以 . 失败。start.resname[1:]''int(start.resname[1:])ValueError
您的堆栈跟踪的其余部分没有提供足够的信息来推断您start.resname没有所需格式的原因。但是尝试在具有调试支持的编辑器中运行您的代码（例如像我在上面的屏幕截图中所做的VSCode），添加充足的断点并尝试单步执行您的代码和 MDAPackmolCode，直到您发现哪里出错了