我有一个关于对不同患者进行的脑 MRI 的nifti文件数据集，我使用名为 Nibabel 的库将它们加载到 Python 中。
这是从我的数据集中拍摄的 MRI 切片：
正如你所看到的，这个头部没有完全对齐（在这种情况下稍微向右倾斜）。由于我想将此 nifti 数据集与神经网络一起使用，因此我想正确对齐每一个 Brain MRI。
我找到了Flirt工具（在 FSL 中找到）（我实际上正在使用Python的包装器），你知道它是否可以用来解决我的问题吗？
如果是，该工具的适当设置是什么？这是我第一次使用 nifti 文件:(
如果此工具不能用于对齐脑 MRI，您知道我可以用于此目的的工具/库吗？