matlab - 如何修改 MATLAB 系统发育树工具中的轴？

Question

我想为我在 Java 中生成的一些凝聚集群显示漂亮的树状图。我将集群写入 Newick 格式的文件中。然后，我可以得到一张几乎是我想要的漂亮照片。

tr = phytreeread('myfile.tree')
phytreetool(tr)

不幸的是，X 轴不是我想要的。我更喜欢“反转”轴，因为聚类的迭代从右到左进行，例如firstName并setFirstName在第一次迭代中得到聚类。有谁知道我该怎么做，或者至少关闭 X 轴标签？（无论如何，默认轴试图告诉我什么？）

Answer 1

首先，您需要访问绘制树状图的轴的句柄。如果它是唯一打开的图形，您可以像这样使用函数FINDALL：

phyAxes = findall(0,'Type','axes');

现在，您要更改的不是x 轴方向，因为这也会反转绘制的树状图。您实际上只想更改用于 x 轴刻度线的标签。如果你只想关闭它们，你可以这样做：

set(phyAxes,'XTick',[]);

现在，我不确定 x 轴要告诉你什么。在您的示例中，对于最左侧的分支点（我猜是“根”），似乎每个分支点都位于沿 x 轴的整数值处，从 0 开始。firstName包含and的最右边的分支setFirstName位于值 21。如果要更改轴标签，使最右边的分支位于 0，而最左边的分支位于 21，则可以按如下方式修改轴：

set(phyAxes,'XTick',0:21,'XTickLabel',num2str((21:-1:0).'));

Answer 2

这可以帮助你吗？

set(gca,'XDir','reverse')

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