我目前正在寻找商业与非商业爆炸工具。我已经多次使用 NCBI 爆炸进行本地爆炸搜索，但现在我正在寻找有趣的替代方案。在搜索过程中，我发现了一些有趣的结果，例如 CUDA-Blast、GPU-Blast、WU-Blast、BlastStation2、mpiBlast 和 Turboblast。任何人都使用过这些工具？或者有没有我错过的类似工具，例如 BlastStation2？我错过了任何重要的商业或非商业爆炸工具吗？
我真的很感谢你的帮助。
谢谢，
贝思
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您可能想查看http://www.sequenceserver.com 它是开源的。它使快速设置本地 BLAST 服务器变得非常容易，您可以获得 Web 界面。（这意味着您也可以与同事分享）。
免责声明：我是开发人员之一。
干杯，
雅尼克
于 2011-06-13T10:57:20.143 回答
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您还应该看看 FASTA 程序，它们提供了相同的比较功能等等。FASTA 程序可以产生 BLAST 输出，因此分析管道需要最少的修改。
于 2012-03-02T13:40:56.210 回答