python - 处理nii.gz时如何避免大数据问题？

Question

我有nii.gz每个文件的数据集，1G包括4d张量。我知道有两种阅读它们的方法，如下所示：

img = nib.load('fMRI.nii.gz')
imgarr = np.array(img.dataobj)

或者

img = nib.load('fMRI.nii.gz')
imgarr = img.get_data()

问题是读取整个张量很昂贵，我只需要一片。还有其他方法吗？

Answer 1

实际上，您不需要将任何主要图像数据加载到内存中。

img = nib.load('fMRI.nii.gz')
 
# get the first 10 slices
img.slicer[0:10]

#verify selection
img.slicer[0:10].shape