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我加载了漂亮的文件(这些文件也是从 .pack CT 扫描转换而来的)。我的目标是使用阈值 otsu 算法从背景中屏蔽它并比较两个图像。当我尝试绘图时,我得到了错误

AttributeError: 'AxesSubplot' object has no attribute 'ravel'

下面是代码,并附上截图。

import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from skimage.filters import threshold_otsu

#THRESHOLD OTSU
img = sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage("\\\\x.x.x.x/users/ddff/python/nifts/prr_ipsi.nii"))
print(img.shape)
thresh = threshold_otsu(img.flatten())
#thresh = thresh.reshape(img.shape)
binary = img <= thresh

#I can plot this image slice fine
plt.imshow(img[20,:,:])

fig, axes = plt.subplots(ncols=1)
ax = axes.ravel()
ax[0] = plt.subplot(1, 3, 1)
ax[1] = plt.subplot(1, 3, 2)
ax[2] = plt.subplot(1, 3, 3, sharex=ax[0], sharey=ax[0])

ax[0].imshow(img[20,:,:], cmap=plt.cm.gray)
ax[0].set_title('Original Breast Delineation')
ax[0].axis('off')

ax[1].hist(thresh, bins=256)
ax[1].set_title('Histogram ')
ax[1].axvline(thresh, color='r')

ax[2].imshow(binary[20,:,:], cmap=plt.cm.gray)
ax[2].set_title('Thresholded')
ax[2].axis('off')

plt.show()[enter image description here][1]
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axes只是一个带有 1 列的数字,所以没有任何东西ravelor flatten。如果您有多个子图,它将起作用。ravel不过,如果您只有一行或一列,则可以执行以下操作。

fig, ax = plt.subplots(ncols=3, sharex=True, sharey=True)

ax[0].imshow(img[20,:,:], cmap=plt.cm.gray)
ax[0].set_title('Original Breast Delineation')
ax[0].axis('off')

ax[1].hist(thresh, bins=256)
ax[1].set_title('Histogram ')
ax[1].axvline(thresh, color='r')

ax[2].imshow(binary[20,:,:], cmap=plt.cm.gray)
ax[2].set_title('Thresholded')
ax[2].axis('off')

如果您想要一个 2d 子图实例矩阵,您可以使用Thomas Kühn's 建议。

fig, ax = plt.subplots(ncols=3, sharex=True, sharey=True, squeeze=False)

然后您可以访问子图

ax[0][0].imshow()
ax[0][1].imshow()
......
于 2019-03-12T13:08:05.953 回答