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在某处我犯了一个非常简单的错误。感谢您指出这个错误发生在哪里......

我想创建一个叠加置信区间和组均值的小提琴图。就像这个了不起的新包装中的示例一样。

没有任何 CI 的通用小提琴图可以正常工作:

p <- ggplot(data=diamonds, aes(x=cut, y=price))
p + geom_violin(aes(x=cut, y=price)) +
  geom_jitter(height = 0, width = 0.1, alpha = 0.05) +
  geom_crossbar(stat="summary", fun.y=mean, fun.ymax=mean, fun.ymin=mean, 
                fatten=2, width=.5)

我的问题是合并置信区间。

我首先创建必要的摘要统计信息:

errbar_lims <- group_by(diamonds, cut) %>% 
  summarize(mean=mean(price), se=sd(price)/sqrt(n()),             
  upper=mean+(2*se), lower=mean-(2*se))

然后我想添加到情节中geom_errorbar

p <- ggplot(data=diamonds, aes(x=cut, y=price))
p + geom_violin(aes(x=cut, y=price)) +
  geom_jitter(height = 0, width = 0.1, alpha = 0.05) +
  geom_crossbar(stat="summary", fun.y=mean, fun.ymax=mean, fun.ymin=mean, 
                fatten=2, width=.5) +
  geom_errorbar(aes(x= ymax=errbar_lims$upper, ymin=errbar_lims$lower), 
                stat='identity', width=.25)

但是 ggplot 的错误一直告诉我,我正在映射到一个单一的组美学,而不是我试图绘制的 5 个组。

也许我的错误是我一开始就设置了映射?


更新

在最初发布后查看了一些评论后,完整的脚本现在如下所示:

errbar_lims <- group_by(diamonds, cut) %>% 
  summarize(mean=mean(price), se=sd(price)/sqrt(n()), 
        upper=mean+(2*se), lower=mean-(2*se))

p <- ggplot(data=diamonds, aes(x=cut, y=price))
p + geom_violin(aes(x=cut, y=price)) +    
  geom_jitter(height = 0, width = 0.1, alpha = 0.05) +
  geom_crossbar(stat="summary", fun.y=mean, fun.ymax=mean, fun.ymin=mean, 
            fatten=2, width=.5) +
  geom_errorbar(aes(x = cut, ymin = lower, ymax = upper), errbar_lims, inherit = FALSE)

然而错误仍然存​​在:

Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'price' not found
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应用于 github 上的精彩代码,你也指出了我。

library(ggplot2)
View(ggplot2::diamonds)

ggstatsplot::ggbetweenstats(data = ggplot2::diamonds, x=cut, y=price, messages=FALSE)

于 2018-09-03T13:43:41.180 回答