r - 我希望能够操纵“phylo”类中的对象 - 即。四舍五入/将我的引导值从小数 (.998) 转换为百分比 (99%)

Question

我正在使用 RStudio、程序猿和phytools. 我已经生成了一棵树，其中存储了 500 个引导复制，存储在 class 的对象中phylo。

我的树的名字在哪里cw，我尝试了以下方法：

round(cw, digits = 2)

我收到以下错误消息：

回合错误（cw，digits = 2）：数学函数的非数字参数

我觉得这可能是一个非常简单的操作，但我不知道如何到达那里。

Answer 1

没有可重复的例子很难说，但我猜你的引导分数可能存储在$node.label你的树的子集中。

您可以尝试以下方法：

## Are the bootstraps in the $node.label object?
if(!is.null(cw$node.label)) {
    ## Are they as character or numeric?
    class(cw$node.label)
}

如果它们是数值：

cw$node.label <- round(cw$node.label, digits = 2)

如果它们是字符，您可能可以强制它们（可以产生一些 NA）

cw$node.label <- round(as.numeric(cw$node.label), digits = 2)