我正在创建一个继承自ete3.Tree
. 我想向newick
对象添加格式化字符串,但我无法找出更新对象的正确方法。 我希望t2
下面的结构t1
与我的结构相同,我的意思是与我构建t2
对象一样,t1
但从一个空ete3.Tree
对象开始。
import ete3
newick = "(((petal_width:0.098798,petal_length:0.098798):0.334371,sepal_length:0.433169):1.171322,sepal_width:1.604490);"
t1 = ete3.Tree(newick=newick, name="hello")
t2 = ete3.Tree(name="hello")
t2.add_child(child=ete3.Tree(newick))
print(t1 == t2)
print(t1.__dict__)
print()
print(t2.__dict__)
# False
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514b1c), Tree node 'sepal_width' (0x12aeb4a9)], '_up': None, '_dist': 0.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514ba1)], '_up': None, '_dist': 1.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
我怎样才能做到这一点?我知道它们不会是相同的哈希,但_children
两个实例之间的属性看起来不同。
Python version 3.6.4
ete3 version: 3.1.1