我遇到了一个奇怪的错误。我不知道是因为 Shiny,还是 pheatmap,还是 RStudio,还是 plotly。
renderPlotly
我需要在同一个 Shiny 应用程序中显示一个来自 pheatmap 的图和另一个图(带有)。两者必须在不同的导航栏上,并且仅在我按下按钮时才需要显示。
如果我绘制 pheatmap,然后绘制 plotly 图,然后返回到热图,只要按下应该生成它的按钮,热图就会消失。
此外,该地图不再适用于下一次运行(请参阅下面有关图形设备的评论)。
plotOutput
如果我对图形使用法线而不是plotlyOutput
(和 renderPlotly) ,则不会发生这种情况。
但是,现在地图绘制在 RStudio 的“绘图”面板上。
在调试时,我注意到在使用时plotlyOutout
,周围有流氓图形设备。例如,当使用 时,使用in处的plotOutput
断点显示“NULL”。
在同一断点处,使用 时,显示:plot(map_reactive)
server.R
dev.list()
plotlyOutput
dev.list()
Browse[2]> dev.list()
RStudioGD quartz_off_screen quartz_off_screen
2 3 4
在调试过程中使用 dev.off() 关闭设备并没有帮助(我不完全知道调试范围是如何工作的),但如果我在停止应用程序后这样做,一切都会再次运行。
这是代码:
用户界面:
# ui.R
library(shiny)
library(plotly)
shinyUI(
navbarPage("Test",
selected = 'map',
tabPanel('map',
sidebarLayout(
sidebarPanel('side',
actionButton('getHmap', 'get heatmap')
),
mainPanel('main',
plotOutput("themap")
)
)),
tabPanel('plot',
sidebarLayout(
sidebarPanel('side',
actionButton('getPlot', 'getPlot')
),
mainPanel('main',
plotlyOutput("theplot")
)
))
)
)
服务器:
# server.R
library(shiny)
library(pheatmap)
shinyServer(
function(input, output, session) {
map_reactive = eventReactive(input$getHmap,{
tmp = data.frame(matrix(1:20,5,4))
tmpmap = pheatmap(tmp, silent = T)
tmpmap$gtable
})
output$themap = renderPlot({
plot(map_reactive())
})
plot_reactive = eventReactive(input$getPlot,{
return(ggplot(data.table(x=1:10, y=1:10), aes(x=x,y=y))+
geom_point()
)
})
output$theplot = renderPlotly({
plot_reactive()
})
})