我正在尝试按照以下示例使用 pvclust 进行集群验证：
result <- pvclust(mydata, method.dist = "euclidean", method.hclust = "ward.D2", nboot = 1000)
这似乎工作正常。但是，如果我将结果可视化：
plot(result)
我无法看到 AU/BP 标签，因为它们被显示为树状图标签的列标题所覆盖。
我尝试使用 dendextend 包来关闭标签，但我没有让它与 pvclust 输出结合使用（结果未显示）。有没有人有我可以使用的方法或包？也许有可能以某种方式放大和剪切图像？我也尝试了 RStudio 的放大功能，但我仍然无法正确看到 AU/BP 标签（参见上面的链接）。
有趣的情况。有几种方法可以处理它。可能最简单的方法是缩写标签（您首先需要 dendextend 以轻松更新标签），并且您需要访问 pvclust 中的 hclust 对象。这是一种方法：
library(pvclust)
library(dendextend)
### example using Boston data in package MASS
data(Boston, package = "MASS")
## multiscale bootstrap resampling (non-parallel)
Boston_too_long_names <- Boston
names(Boston_too_long_names) <- paste0(names(Boston_too_long_names), "000000000000000000000000000000000000000000000")
boston_pv <- pvclust(Boston_too_long_names, nboot=5, parallel=FALSE)
par(mfrow = c(1,2))
plot(boston_pv)
labels(boston_pv$hclust) <- abbreviate(labels(boston_pv$hclust), 5, strict = TRUE)
plot(boston_pv)
You can use idendr0 package which can let you zoom in/out on the plot.
for installing the package use:
install.packages("idendr0")
plot with :
idendr0(result)
you can find more example in the this document : Idendr0 documentation