r - 如何在 R 中相交两个 data.frames？

Question

我有两个表在 data.frame 结构中。表 1 包含一列 200 个基因 ID（字母和数字），表 2 包含 4,000 个基因 ID（按行）的列表以及 20 个附加列。我想将这两个表相交并生成一个新的表 3，其中包含 200 个基因 ID 以及 20 列中的相关信息。

表 3 <- 表 1%n%表 2

Answer 1

你想要类似的东西

table3 <- merge(table1, table2, by.x="id", by.y="id", all.x=T, all.y=F)

您也可以使用以下方法进行子集化：

table3 <- table2[table2$id %in% table1$id,]

reprex 会使这篇文章更有可能得到很好的回应，但你应该能够找到一些东西来帮助你进行一些搜索。如果这些都不起作用，因为您遇到了以前没有人问过的独特问题，那么给予是一种代表，我们可以尝试为您提供替代解决方案。

编辑：对于更多的上下文，这是我上周回答的一个类似问题，这是一篇关于理解合并的好帖子。

Answer 2

我推荐这个dplyr包。它比merge我认为的更直观。

你可以输入：

table3 <- left_join(table1, table2, by = "unique_id")