bioinformatics - 如何仅对 TrEMBL 进行 BLAST

Question

我正在使用 BioPython 进行命令行 BLAST。我需要搜索 TrEMBL，但我无法找到如何做到这一点。我知道我可以选择 db="nr"，这很有效，但我只想搜索 TrEMBL，它构成 nr 序列的子集。另外，我需要能够在线进行，而不是远程进行！

编辑：如果有人遇到同样的问题：经过大量实验，我设法完成这项工作的唯一方法是下载 NCBI BLAST+ 并在独立准备好的库上进行远程搜索。如有疑问，请与我联系。