python-3.x - 获取给定 taxID 下的 NCBI taxID

Question

有点类似于这个线程：

如何从出租车中获取分类等级名称？

我有一个属的taxID，我想提取该属下的所有taxID 或登录号。任何人都可以建议吗？

Answer 1

ETE 工具包也可以在这里提供帮助。ETEtoolkit 教程的“获取后代分类单元”部分是您所需要的。有关更多详细信息，请参见链接。相关代码如下。

例如，taxID 171 属（钩端螺旋体）

from ete3 import NCBITaxa
ncbi = NCBITaxa()
descendants = ncbi.get_descendant_taxa(171)
# to print names of the taxIDs in the descendants
print(ncbi.translate_to_names(descendants))