r - ggraph包中带有树状图的“找不到对象'方向'”

Question

我尝试用ggraph包绘制树状图，但是可以，geom_edge_diagonal()但不能geom_edge_elbow()

套餐

library(phyloseq)
library(igraph)
library(ggraph)

获取数据

文件 ps.rds 可在此处获得

ps <- readRDS("ps.rds")

EdgeList <- phy_tree(ps)$edge
Tree <- graph_from_edgelist(EdgeList, directed = TRUE)

绘图

ggraph(Tree, 'dendrogram') +
  geom_edge_diagonal()

此代码有效，但情节不是很漂亮。

现在：

ggraph(Tree, 'dendrogram', circular = TRUE) +
  geom_edge_elbow()

Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'direction' not found

所以我有一些问题：

为什么它不起作用，因为它适用于其他树状图？
什么是方向？在包文档中，据说方向是“自动设置的” https://www.rdocumentation.org/packages/ggraph/versions/0.1.1/topics/geom_edge_elbow
我能找到一些对在 ps 对象中绘图有用的东西吗？

F. Privé 评论后编辑

是的，可以混合dendrogram和circular。

ggraph(Tree, 'dendrogram', circular = TRUE) +
  geom_edge_diagonal()

score 2 · Accepted Answer

由于某些原因在这里无法讨论，geom_edge_elbow目前仅支持 dedrogram/hclust 对象，不支持 igraph 对象。

我可能会在下一个版本中找到解决方法

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