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我又在这里提出了另一个关于 python 中 SimpleITK 的问题。我想绘制一个 .mhd 图像，但我不知道如何。我正在尝试这里描述的函数Reading *.mhd/*.raw format in python：

load_itk('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')

但它没有读取图像：

RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:483:
itk::ERROR: MetaImageIO(0x3a83730): File cannot be read: /home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd for reading.
Reason: Success

我也尝试过使用 scikit 图像...

img = io.imread('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd', plugin='simpleitk')

但我也收到一条错误消息

RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:483:
itk::ERROR: MetaImageIO(0x3a84280): File cannot be read: /home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd for reading.
Reason: Success

即使使用 medpy

from medpy.io import load
image_data, image_header = load('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')

Traceback (most recent call last):
  File "<pyshell#17>", line 1, in <module>
    image_data, image_header = load('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')
  File "medpy/io/load.py", line 201, in load
    raise err
DependencyError: Loading images of type Itk/Vtk MetaImage (.mhd, .mha/.raw) requires a third-party module that could not be encountered. Reason: No module named itk.

但我现在确实有 SimpleITK。我不明白发生了什么... =(

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2 回答 2

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您尝试读取的文件是否有效？您可以使用其他一些图像显示工具进行检查，例如ITK-SNAP或3D Slicer。如果这些工具中的任何一个都可以打开它，请告诉我们您正在使用的 SimpleITK 版本。

于 2017-07-24T22:11:51.977 回答
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MHD 文件通常需要一个 mhd 标头和一个包含图像数据的原始文件 - 您是否将两者都放在同一个目录中，并且 mhd 标头指向数据？

于 2018-11-19T00:37:39.717 回答