我已经成功制作了 NMDS 图(monoMDS、bray-curtis、3 维、局部模型)。每个点代表一种动物及其饮食组成。
我有两个问题:
(1)如何更改点的符号系统以在 NMDS 图的 1 列(生命阶段)内显示 2 个级别(a 或 j)?!
(2) 我应该如何显示 3D NMDS,我无法让 3D orgl- 函数在 3D 绘图上工作。我应该只制作一些显示 2D 不同维度的图吗?寻找深思熟虑的想法。
使用的代码:
plot((BC.NMDS.length.corr), choices = c(1, 2), type = "points",
xlim = c(-2.0, 2.0),las = 1, ylim = c(-1, 1),
xlab = "NMDS Axis 1", ylab = "NMDS Axis 2",mgp = c(3.25, 1, 0),
cex.lab = 1.35, cex.axis = 1.25)
with(DATA,
points(BC.NMDS.length.corr, Class, draw = "points",col = "gray0",
show.groups = "Adult",label = TRUE, lty = 1, lwd = 2))