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我有一个简单的 shell 脚本，用于构建我的 Roxygen 文档、构建包、检查，然后在我的机器上安装新构建的包。这很简单：

#! /bin/sh
R CMD roxygen -d myPackage 
R CMD build myPackage/
R CMD check myPackage_0.01.tar.gz
R CMD INSTALL myPackage myPackage_0.01.tar.gz

但是我遇到了 Roxygen 拾取我的 .onLoad() 函数的问题，如前所述 StackOverflow。解决方案是将 use.Rd2=TRUE 选项与 roxygenize 一起使用。好吧，我想从命令提示符构建，所以我更改了这一行

R CMD roxygen -d myPackage

到以下行，该行通过标准输入将 roxygenize 行推到 R ：

echo 'require("roxygen"); roxygenize("myPackage", roxygen.dir="myPackage",
   copy.package=FALSE, use.Rd2=TRUE)' | R --no-save < /dev/stdin

这似乎只是花花公子。但是感觉有点绕。有没有更简单和/或更优雅的方式？

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可能是R CMD roxygen -s选项会在这里有所帮助。我相信它实际上与函数use.Rd2=TRUE中的设置相同。roxygenize

于 2010-12-07T22:24:49.597 回答
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我做了类似的事情，但我在 shell 脚本中使用了 HERE 文档以使其看起来更干净。

#!/bin/sh
##
##
## Must be run from the parent of the package directory (no options
## to change target of check or tarball!?!)

PACKAGE="analyzeNMON"
VERSION=$(awk -F": +" '/^Version/ { print $2 }' ${PACKAGE}/DESCRIPTION)

R --no-restore --slave <<EOR
  library(roxygen)
  roxygenize(package.dir="${PACKAGE}",
             roxygen.dir="${PACKAGE}",
             use.Rd2=TRUE,
             overwrite=TRUE,
             copy.package=FALSE,
             unlink.target=FALSE)
EOR

R CMD build ${PACKAGE}
R CMD check ${PACKAGE}_${VERSION}.tar.gz
R CMD INSTALL ${PACKAGE}_${VERSION}.tar.gz

R 代码与在R CMD roxygen.

我系统上安装的 roxygen（0.1 版；本周从 CRAN 安装）似乎不支持上述-s选项...

于 2010-12-24T02:08:00.620 回答