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我有一个蛋白质组学数据集,我在其中比较了两个条件,因此我有条件 A(8 个重复)和条件 B(9 个重复)。

在蛋白质组学中,我们并不总是对每个重复进行测量,但我们不想消除蛋白质观察(每一行都是蛋白质),因为 8 个重复中有 1 个呈现 NA 值。

我想在测试中使用,我尝试了函数 na.action = "na.pass" 但出现以下错误:

 Error in t.test.default(x[1:8], x[9:17], paired = FALSE, na.action = "na.pass") : 
  not enough 'x' observations 

我给你一个数据集的例子:

        C1_1  C1_2  C1_3  C1_4  C1_5  C1_6  C1_7  C1_8  C2_1 C2_2   C2_3  C2_4  C2_5  C2_6  C2_7  C2_8   C2_9
Prot_1  4.42    NA  0.73  0.47  0.84    NA  1.24  0.99 1.21  0.84   0.64  0.61  0.76  0.29  0.88  4.09   1.15
Prot_2  0.56  0.30  0.30  0.27  0.18  0.48  0.59  0.20 0.36  0.40   0.44  0.49  0.33  0.67  0.30  0.50   0.75

我将非常感谢您的帮助,

最好的祝愿,

朱莉娅

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