一段时间以来,我一直在非常强大的服务器上使用 ete2 模块。一切都很好,直到它开始变得非常缓慢(get_taxid_translator()
每分钟一个功能),现在我什至无法完成ncbi = NCBITaxa()
任务。我已经卸载并重新安装了 anaconda2,尝试更新到 ete3,在我们的“开发服务器”上一切正常,但仍然无法通过ncbi = NCBITaxa()
我们普通服务器上的任何软件。即使以下脚本也无法完成
#!/usr/bin/env python
from ete3 import NCBITaxa
ncbi = NCBITaxa()
print "Finished"
这有发生在其他人身上吗?我需要降级任何依赖项吗?会不会是权限问题?当我运行基本脚本时,ctrl+c 或 ctrl+z 都不会转义脚本,我必须使用它kill -9 <job-id>
来杀死脚本。如果我等待太久,进程将进入不间断睡眠。
提前谢谢你,亚历克西斯。
Python 2.7.12 :: Anaconda 自定义(64 位)gcc (GCC) 5.4.0