shiny - 使用 Flexdashboard 部署 Shiny 应用程序

Question

我知道如何使用http://www.shinyproxy.io/部署闪亮的应用程序。基本上我只需要 server.R 和 ui.R。然后使用 docker 就很容易了。

但是，当使用 flexdashboard 时，我只有 .rmd 文件。我现在如何实施此部署？

Answer 1

这实际上是由 ShinyProxy开箱即用的。您只需要yourfile.Rmd在 docker 镜像中添加文件（即在您的 Dockerfile 中添加相关命令），然后使用

docker-cmd: ["R", "-e rmarkdown::run('/path/to/yourFile.Rmd')"]

在apps区块的相关领域。此处有关应用程序配置的完整详细信息

Answer 2

渲染 Shiny R Markdown 文档需要服务器端支持。这是开源 Shiny Server 产品的一个功能（请参阅Shiny Server 文档），它似乎没有被 ShinyProxy 实现。

如果您想添加对 ShinyProxy 的支持，这不会很困难；有一些细节需要解决，但基本上代理只需要使用rmarkdown::run()而不是shiny::runApp().

Answer 3

您可以在这里查看如何使用 R Flexdashboard 制作 Docker 映像。然后，您必须将 Shinyproxy 的 application.yml 中的容器 cmd 更改为["R", "-e", "rmarkdown::run('/...."]用于呈现 Rmd Flexdashboard 文件。请参阅我的博客文章： https ://medium.com/analytics-vidhya/deploying-a-shiny-flexdashboard-with-docker-cca338a10d12