只是想知道名称为 dockstore-tool-samtools-index 的 docker 映像是否可在此处“https://quay.io/repository/cancercollaboratory/dockstore-tool-samtools-index”获得并作为 Google 的输入Genomics API (pipelines.create) 包含基因组工具，例如 GATK/BWA 或 Cromwell。对此的任何帮助将不胜感激。
谢谢。
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它似乎不包含那些额外的工具：https ://github.com/CancerCollaboratory/dockstore-tool-samtools-index/blob/master/Dockerfile
以下是检查方法：
- 在https://dockstore.org/search-containers上找到 docker 容器。
- 单击感兴趣容器所在行中的“GitHub”链接。
- 阅读 的内容
Dockerfile以查看图像将包含的内容。
于 2016-05-17T16:58:55.867 回答
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Docker 镜像的一个方面是它们通常会尝试只安装一个特定的工具。通过这种方式，图像可以尽可能小，因为它们可以像模块一样使用。
上面 Nicole 提供的 Dockstore 搜索链接中列出了已安装 BWA 的图像。Cromwell 通常会启动 Docker 容器，而不是安装在 Docker 映像上，因为它更多的是工作流管理系统。随时欢迎您使用首选的已安装软件包创建自己的自定义映像，以满足您的需求。
希望能帮助到你，
保罗
于 2016-05-18T07:02:45.420 回答