python - 列出神经元部分属性/信息的简单方法？

Question

在 NEURON 模拟器中，除了单独迭代每个属性之外，是否有更简单的方法来列出部分的属性？

Answer 1

有psection()方法。一旦感兴趣的部分被push()编辑。在 Python 中键入psection()orh.psection(sec=your_section)将产生以下示例结果：

>>> h.psection(sec=h.Granule[0].soma)

Granule[0].soma { nseg=1  L=8  Ra=80
    /*location 0 attached to cell 5*/
    /* First segment only */
    insert morphology { diam=8}
    insert capacitance { cm=4}
    insert pas { g_pas=0 e_pas=-65}
    insert kamt { gbar_kamt=0}
    insert nax { sh_nax=15 gbar_nax=0}
    insert na_ion { ena=60}
    insert kdrmt { gbar_kdrmt=0}
    insert k_ion { ek=-90}
    insert Exp2Syn { tau1=5 tau2=50 e=0}
    insert IClamp { del=50 dur=200 amp=0.09}
}

Answer 2

如果您使用的是NEURON gui，您还可以在 NEURON 的控制菜单中找到部分属性：

工具-> 模型视图

这将打开一个 ModelView 窗口，其中包含部分和段详细信息，例如：

• 细胞类型：真实细胞/人造细胞
• NetCon对象
• LinearMechanisms对象
• 密度机制
• 点流程

如果单击每个属性，则会出现一个下拉菜单，其中显示所选属性的详细信息

如果单击细胞类型（真实/人造细胞），您还可以查看模型的结构