image-processing - 如何从 fmri 中提取特征？

Question

我有 fmri 数据集，用于对正常对照和阿尔茨海默病患者进行分类。现在，作为一个新手，我无法从我的数据集中提取特征。我想以数字形式提取激活模式、GM、WM、CSF、体积测量和血液动力学。请指导我如何以及从哪里开始，并为我的工作推荐一些简单有效的软件......我将不得不......

Answer 1

就像@WeirdAlchemy 所说，这些是您想要执行的许多分析，而且所有这些分析都不是微不足道的。您通常会在相关的强化课程中数周或在神经硕士课程中数月学习这些内容。要非常明确地回答您的问题：

• GM、WM 和 CSF 体积测量 - 您可以使用FSL SIENA、SPM VBM、AFNI 3Dclust等进行此操作。
• “提取激活模式”太模糊了。很可能，您可能拥有与任务相关的 BOLD fMRI 数据并希望执行一般线性模型 (GLM) 分析。FSL FEAT，SPM fMRI， AFNI 和其他支持这一点。但是，在不了解实验设计、数据性质以及您想从中学到什么的情况下，很难更具体地确定哪种工具是合适的。
• “数值形式的血流动力学” 这可能意味着很多事情，但是如果您正在考虑血流动力学信号调制的量（例如，条件导致 BOLD 信号发生 2% 的变化），您可以从上面提到的 GLM 分析中得到.

Answer 2

查看名为 FSL（FMRIB 软件库）和 SPM（统计参数映射）的软件包。

他们每个人都可以进行您所要求的分析。但是，请注意，这些分析都不是微不足道的。您可能应该首先阅读有关该主题的一些内容。功能 MRI 数据分析手册是初学者入门的好地方。