python - 如何在 PyCharm 中将 RDKit 添加到项目中？

Question

所以，我正在尝试将 RDKit 添加到我在 PyCharm 中的项目中。我发现如果你使用解释器/usr/bin/python2.7PyCharm 会尝试使用pip. 同时，RDKit 需要conda. 我试图将解释器更改为conda，但RDKit不在列表中，或者无法打开带有 repo 的 URL。有谁知道如何解决这个问题？

顺便说一句，在安装东西的同时，是否有可能让解释器/usr/bin/python2.7使用其他任何东西（不是pip）？

Answer 1

我终于找到了如何做到这一点，这并不难：

1. 安装康达；
2. 按照这些说明安装 RDKit
3. 像这样转到 PyCharm 中的首选项：

或者像这样（你需要一个扳手）：

4. 在项目解释器中选择：~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python

5. 确保将相应的 python 路径添加或更新到 PATH，否则它将不起作用。

测试：

1. 尝试安装 fiona - 成功，因此对安装没有影响；
2. 尝试了简单的代码：print('HELLO WORLD!')- 工作

3. 试过rdkit代码

       from rdkit import Chem
   
   
       m = Chem.MolFromSmiles('Cc1ccccc1')
   
       print(m)
   

工作，日志：<rdkit.Chem.rdchem.Mol object at 0x101125080>

Answer 2

另一种选择是在 PyCharm 中创建新项目时选择现有的虚拟环境。完成 Anna 上面列出的步骤后，“创建项目”屏幕的“以前配置的解释器”部分应该显示 ~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python 作为选项。