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我正在尝试生成一个条形图，以便 x 轴由患者组成，每个患者都有多个样本。例如（使用 mtcars 数据作为数据外观的模板）：

library("ggplot2")
ggplot(mtcars, aes(x = factor(cyl), group = factor(gear))) +
   geom_bar(position = position_dodge(width = 0.8), binwidth = 25) +
   xlab("Patient") +
   ylab("Number of Mutations per Patient Sample")

这将产生如下内容：

在此处输入图像描述

每个条形图代表每个患者的样本。

我想通过使用颜色填充条形图来添加有关每个患者样本的附加信息（例如，每个患者样本中的不同类型的突变）。我在想我可以像这样指定填充参数：

ggplot(mtcars, aes(x = factor(cyl), group = factor(gear), fill = factor(vs))) +
   geom_bar(position = position_dodge(width = 0.8), binwidth = 25) +
   xlab("Patient") +
   ylab("Number of Mutations per Patient Sample")

但这不会为每个患者样本条形图生成“堆叠条形图”。我假设这是因为 position_dodge() 已设置。有没有办法解决这个问题？基本上，我想要的是：

ggplot(mtcars, aes(x = factor(cyl), fill = factor(vs))) +
   geom_bar() +
   xlab("Patient") +
   ylab("Number of Mutations per Patient Sample")

在此处输入图像描述

但是在我列出的第一个情节中可以使用这些颜色。ggplot2 可以吗？

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4 回答 4

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我认为方面是您似乎正在寻找的最接近的近似值：

ggplot(mtcars, aes(x = factor(gear), fill = factor(vs))) +
    geom_bar(position = position_dodge(width = 0.8), binwidth = 25) +
    xlab("Patient") +
    ylab("Number of Mutations per Patient Sample") +
    facet_wrap(~cyl)

情节的结果

我在 ggplot2 的问题跟踪器中没有找到任何相关内容。

于 2015-07-28T21:41:09.810 回答
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如果我正确理解您的问题，您希望将 aes() 传递到您的 geom_bar 层。这将允许您通过填充美学。然后，您可以根据要显示数据的方式将条形图放置为“闪避”或“填充”。

此处列出了一个简短的示例：

   ggplot(mtcars, aes(x = factor(cyl), fill = factor(vs))) +
      geom_bar(aes(fill = factor(vs)), position = "dodge", binwidth = 25) +
      xlab("Patient") +
      ylab("Number of Mutations per Patient Sample")

结果图： http: //imgur.com/ApUJ4p2（抱歉，S/O 不允许我发布图片）

希望有帮助！

于 2015-07-28T21:40:19.613 回答
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我已经通过按照我喜欢的顺序将多个 geom_cols 分层来解决这个问题几次。例如，代码

    ggplot(data, aes(x=cert, y=pct, fill=Party, group=Treatment, shape=Treatment)) +
      geom_col(aes(x=cert, y=1), position=position_dodge(width=.9), fill="gray90") +
      geom_col(position=position_dodge(width=.9)) +
      scale_fill_manual(values=c("gray90", "gray60"))

允许我制作您正在寻找的功能而无需刻面。请注意我如何将背景层的 y 值设置为 1。要添加更多层，您可以对变量进行累积求和。

情节图片：

阴谋

于 2017-11-17T02:05:35.247 回答
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我想，我在这篇文章中的回答将帮助您为每个患者构建带有多个堆叠垂直条的图表......

ggplot中的分层轴？

于 2015-07-29T07:06:01.000 回答