3

我正在尝试使用 Python 中的 ETE2 模块创建一棵树。我想将 1 个子节点添加到 2 个父节点,以便在显示树时它们都连接到子节点。我是 ETE 的新手,所以如果这是一个简单的问题,请原谅我。代码:

from ete2 import Tree, TreeNode, TextFace


classes = Tree()

#adding 1
course1 = TreeNode(name="Course 1")
face1 = TextFace(text="Course 1")
course1.add_face(face1, column=1)
classes.add_child(child=course1)

#adding 2
course2 = TreeNode(name="Course 2")
face2 = TextFace(text="Course 2")
course2.add_face(face2, column=1)
course1.add_child(child=course2)

#adding 3
course3 = TreeNode(name="Course 3")
face3 = TextFace(text="Course 3")
course3.add_face(face3, column=1)
#adding course3 to 2 parents
course1.add_child(child=course3)
course2.add_child(child=course3)

classes.show()

输出是这里

我从根本上反对这里的树的想法吗?ETE 是否有一种简单的(r)方法来执行我的建议?

如果您需要更多信息来帮助,请告诉我。

4

1 回答 1

2

我基本上找到了自己问题的答案:我应该使用的数据结构不是树。@boardrider 指出,树本质上是“一对多”结构,将一个父节点映射到一个或多个子节点。

解决方案是有向无环图。这是图形数据结构的一种变体,它映射“多对多”以继续上面的措辞。

资源:

图数据结构基础

Python 特定的图结构

随着我的进步,我将对此进行编辑。

于 2015-07-25T00:51:14.133 回答