3

我正在尝试为广义加法混合模型(使用gamm4使用 R 中的MuMIn包制作)进行模型选择。我本质上是在尝试按照这篇文献来使用 MuMIn 和 gamm4 进行模型选择。

我正在创建一个包含 9 个变量和随机个体效应的模型 - 看起来像这样:

library(gamm4)
library(MuMIn)
SouthFull = gamm4(OtoWidth ~ s(Ages) + 
                 LagFinFSLdat_AnnEsts +
                 FSL_months_Feb +
                 LagFSLdat_Annual +
                 LagFSLdat_Spring +
                 LagFSL_months_Oct+
                 FinFSLdat_SummerDat +
                 FinFSLdat_AutumnDat +
                 LagFSL_months_Nov , random = ~(1|FishName), data = South)

但是当我尝试使用该dredge功能时,它会失败并显示错误消息:

(dd <- dredge(global.model=SouthFull))
Error in dredge(global.model = SouthFull) : result is empty

    In addition: There were 50 or more warnings (use warnings() to see the first 50)
    > warnings()
    Warning messages:
    1: In gamm4::gamm4(...) : family not recognized (model 1 skipped)
    ...
    50: In gamm4::gamm4(...) : family not recognized (model 50 skipped)

这是由于 MuMIn 无法识别 gamm4 模型系列的问题吗?

完整的代码和数据可以在我的GitHub 存储库中找到,具体问题在代码gamm_analysis.R中,具体警告在第 81 行。

先感谢您

4

1 回答 1

1

我认为包裹有问题。我有同样的错误。然后,我尝试在 MumIn 包的函数 dredge 的帮助下运行可用的示例,以查看我在做什么不同,即使使用下面的示例,我也会得到相同的错误:

fm1 <- lm(y ~ ., data = Cement)
dd <- dredge(fm1)

错误信息是:

Error in nobs.default(global.model) : no 'nobs' method is available
于 2018-10-01T17:51:59.450 回答