我正在尝试使用介绍性文本中的示例从 R 运行 WinBUGS。实际上,我使用的是相同的示例,并且与这个人有一个非常相似的问题:
但我收到一条不同的错误消息,并且此线程中的建议(例如,以管理员身份运行 R,定义 BUGS 目录)没有奏效。
我的电脑归我的大学所有,所以我怀疑权限问题是有问题的。我最初在 Program Files 文件夹中安装了 WinBUGS,但在阅读此站点后,我尝试将其安装在我的 Users 文件夹中。无论如何,我都收到了相同的错误消息。
这是我收到的警告消息:
警告消息:运行命令 '"C:/Users/crowe106/WinBUGS14/WinBUGS14.exe" /par "C:/Users/crowe106/Desktop/School Stuff/R/WinBUGS/script.txt"' 的状态为 28462
WinBUGS 运行,但 R 崩溃并且未创建对象 out。有谁知道状态 28462 是什么意思?
谢谢您的帮助。
克里斯
这是代码:
library(R2WinBUGS) # Load the R2WinBUGS library
# Save BUGS description of the model to the working directory
sink("model.txt")
cat("
model {
#Priors
population.mean~dunif(0,5000) # Normal parameterized by precision
precision <- 1/population.variance # Precision = 1/variance
population.variance <- population.sd * population.sd
population.sd~dunif(0,100)
# Likelihood
for(i in 1:nobs) {
mass[i]~dnorm(population.mean, precision)
}
}
", fill=TRUE)
sink()
# Package all the stuff to be handed over to WinBUGS
# Bundle data
win.data <- list(mass=y1000, nobs=length(y1000))
# Function to generate starting values
inits <- function()
list(population.mean=rnorm(1,600), population.sd=runif(1,1,30))
# Parameters to be monitored (= to estimate)
params <- c("population.mean", "population.sd", "population.variance")
# MCMC settings
nc <- 3 # Number of chains
ni <- 1000 # Number of draws from posterior (for each chain)
nb <- 1 # Number of draws to discard as burn-in
nt <- 1 # Thinning rate
# Start Gibbs sampler: Run model in WinBUGS and save results in object called out
out <- bugs(data=win.data, inits=inits, parameters.to.save=params, model.file="model.txt",
n.thin=nt, n.chains=nc, n.burnin=nb, n.iter=ni, debug=TRUE, DIC=TRUE, working.directory=getwd(),
bugs.directory = "C:/Users/crowe106/WinBUGS14")
我最初在没有 bugs.directory 行的情况下运行它并得到了相同的错误消息。