bioinformatics - 从微阵列构建 .sif 文件，仅包含表达值和基因 ID 的 tab 文件

Question

如何.sif (simple interaction)从仅包含基因表达值和基因名称的基因微阵列表达 .tab 文件生成文件？我使用 Expander 软件和 MeV 并想为Cytoscape and Spike software. 是否有任何 R 包或特定的插件或软件用于此目的？

我可以根据预先计算的基因之间的相关性手动编写 .sif 文件：

CD31 pp CD34
BRCA pp CD31
VEGF pp CD34

但是，不知道如何使用其他指标自动生成它。

谢谢