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我已经安装了 bioperl，但对在哪里获取它以及在哪里运行 bioperl 程序感到困惑。然后我对其进行了测试，它成功了我已经为多个 seq 运行了一个程序。结盟。

产生了错误

无法在 @INC 中找到 Bio/Tools/Run/Alignment/Clustalw.pm（@INC 包含：/etc/perl /usr/local/lib/perl/5.14.2 /usr/local/share/perl/5.14. 2 /usr/lib/perl5 /usr/share/perl5 /usr/lib/perl/5.14 /usr/share/perl/5.14 /usr/local/lib/site_perl .) 在 msa.pl 第 3 行。开始失败--编译在 msa.pl 第 3 行中止。

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这意味着Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw模块丢失。你需要安装它。用来cpan Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw安装它。

另请参阅：在 perl 中自动安装 perl 依赖项

于 2014-06-03T05:54:59.403 回答