我是R的初学者。
我想使用 ape 包中的 R clustal 函数来处理我的 DNA 序列,所以我可以使用 {pegas} 进行进一步的分析。
但是,当我第一次尝试手册中提供的示例时:
clustal(woodmouse, pw.gapopen = 1, pw.gapext = 1, exec = "clustalw2")
但我收到一条错误消息:
/bin/sh: clustalw2: command not found
Error in file(file, "r") : cannot open the connection. In addition: Warning massage: In file(file, "r") : cannot open file '/var/folders/vm/fzyykk3x21g55fdvpctj7s900000gn/T//Rtmp0RjsMr/input_clustal.aln' :No such file or directory
我想知道如何解决这个问题?顺便说一句,我使用的操作系统是 Mac OS 10.9。谢谢你。