import numpy
from scipy.spatial.distance import pdist
X = numpy.zeros(50000,25)
C = pdist(X, 'euclidian')
我想找到：
然后 numpy 给出错误：数组太大。
我认为问题在于 C 的数组大小。Pdist 无法创建 (50000,50000) 数组。我不知道为什么 numpy 限制？我可以在 matlab 中运行相同的代码。如何使用数组运行此代码？
而且，我发现可能存在重复，但它们的数组矩阵大小太大。
首先，您的代码中有几个拼写错误。它的：
X = numpy.zeros((50000,25)) # it's a tuple going in
C = pdist(X, 'euclidean') # euclidean with an e
当然，这个问题并不重要。
欧几里得 pdist 只是对 numpy.linalg.norm ( http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.linalg.norm.html ) 的调用。这是一个非常通用的功能。如果由于内存限制它在您的情况下不起作用，您始终可以自己创建一些东西。两个 50000 长度的向量不会占用太多内存，这可以进行一对两比较：
np.sqrt(np.sum(np.square(X[0])) + np.sum(np.square(X[1])))
然后你只需要循环整个事情。
希望有帮助，P