r - NA 正在 boxplot ggplot2 中绘制

Question

我正在尝试在 ggplot2 中绘制一个简单的箱线图。我有物种丰富度与土地利用类别。但是，我的数据中有 2 个 NA。出于某种奇怪的原因，它们正在被绘制，即使它们被 R 理解为 NA。有什么建议可以删除它们吗？

我正在使用的代码是：

ggplot(data, aes(x=luse, y=rich))+
  geom_boxplot(mapping = NULL, data = NULL, stat = "boxplot", position = "dodge", outlier.colour = "red", outlier.shape = 16, outlier.size = 2, notch = F, notchwidth = 0.5)+
  scale_x_discrete("luse", drop=T)+
  geom_smooth(method="loess",aes(group=1))

但是，该图包括 2 个用于 luse 的 NA。不幸的是，我无法发布图片，但想象一下我的图表中添加了一个 NA 条。

Answer 1

您可以尝试subset()在代码的第一行中使用该函数

ggplot(data=subset(data, !is.na(luse)), aes(x=luse, y=rich))+

如建议：从 ggplot 中消除 NA

Answer 2

这是使用上述评论!is.na()与filter()tidyverse/dplyr 合并的正式答案。如果您有基本的 tidyverse 操作，例如过滤 NA，您可以ggplot按照建议在调用中直接执行，以避免创建新的数据框：

ggplot(data %>% filter(!is.na(luse)), aes(x = luse, y = rich)) + geom_boxplot()

Answer 3

您还可以使用filter()dplyr/tidyverse 中的函数：

data %>% filter(is.na(luse) == FALSE) %>% 
   ggplot(aes(x=luse, y=rich)) +
   geom_boxplot()

这样您就不必创建新对象。