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我正在维护一个 R 包，该包最近开始在以下期间抛出以下警告R CMD check packagename：

** testing if installed package can be loaded Warning: multiple methods tables found for ‘append’

（这个包叫做phyloseq，目前导致我这个问题的分支在这里）

细化子问题：

    • 所以“多个方法表”部分，这似乎暗示我有两个依赖包，在append方法的调度上发生冲突。正确的？
    • 我没有"append"在这个包中命名的函数/方法，也没有导入任何函数/方法。
    • 通过简单地同时在 R 中加载两个包，我能够在新的 R 会话中重现警告消息，其中一个（RJSONIO）是二级依赖项——我的意思是我的一个依赖项（biom）取决于它，但不是我的： library("RJSONIO");library("Biostrings")

这会在 R 会话中引发警告：

multiple methods tables found for ‘append’

自然地，在RJSONIO 和Biostringsappend的文件中导出。我不明白为什么在加载我的包时这会导致问题。我直接依赖的包（Biostrings-2.28.0，biom-0.3.8）没有完全导入——当然没有导入任何方法。否则怎么会出现这种冲突？NAMESPACEappend

解决方法：

如果我将 Biostrings 更新到“开发”版本 2.29.2，那么警告似乎就会消失。然而，大多数用户不会这样做，我仍然想了解这种冲突是如何发生的，因为我专门从这些包中导入函数和类而不是完整的Import或Depends.

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