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是否有使用并行计算在 R 中进行矩阵求逆的包？

谢谢！

你好。我在安装 HiPLARb 包时遇到问题，这是我所做的：

下载自动安装脚本：http ://www.hiplar.org/downloads/HiPLARb.Installer

./HiPLARb.Installer --with-openblas --no-gpu --prefix=/home/kaiyin/mylib 一切顺利，所有 prerequesite 库都安装成功，还有 R 2.15.2 的补丁版本

从http://www.hiplar.org/downloads/HiPLARb_0.1.3.tar.gz下载包

修改 shell PATH 以预先添加修补的 R bin 目录。

R CMD INSTALL --configure-args="--with-lapack= \ 
-L/home/kaiyin/mylib/lib\ -lopenblas \ 
--with-plasma-lib=/home/kaiyin/mylib \ 
--with-magma-lib=/home/kaiyin/mylib" HiPLARb_0.1.3.tar.gz

我收到以下错误：

配置：错误：无法识别的选项：`-L/home/kaiyin/mylib/lib -lopenblas'

尝试 `./configure --help' 获取更多信息

错误：包 HiPLARb 的配置失败

请帮忙，谢谢！

由于 -lopenblas 不是有效的配置选项，我将其删除并重试：

R CMD INSTALL --configure-args="--with-lapack=/home/kaiyin/mylib/lib\
--with-plasma-lib=/home/kaiyin/mylib \ 
--with-magma-lib=/home/kaiyin/mylib" ../HiPLARb_0.1.3.tar.gz

这次出现新错误：

configure: error: invalid variable name: ` --with-magma-lib'

第三次尝试：

R CMD INSTALL --configure-args="--with-lapack=/home/kaiyin/mylib/lib\
--with-plasma\
--with-magma\ 
--with-plasma-lib=/home/kaiyin/mylib \ 
--with-magma-lib=/home/kaiyin/mylib" ../HiPLARb_0.1.3.tar.gz 

configure: WARNING: you should use --build, --host, --target
configure: WARNING: invalid host type:  
checking "if PLASMA libraries exist"... configure: WARNING: "No PLASMA option given."
configure: WARNING: "No CUDA option given."
configure: WARNING: "No MAGMA option given."
configure: error: Cannot find MAGMA or PLASMA Libraries. Please install MAGMA, PLASMA or both. Please see the install guide for more details.
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是的，有几个；但这取决于您所说的并行是什么意思。

如果您的意思是非常大规模的并行性，例如不适合单台机器并且您需要一个集群来处理它，那么就有PBD 包。这些需要安装 MPI 和 Scalapack 等软件包，但它们通常可以在任何用于大型技术计算的集群上使用。

如果矩阵适合单个节点并且您只想将所有 CPU 投入其中，则HiPLAR包可以使用多个 cpu 甚至基于 PLASMA 或 MAGMA 库的 GPU（再次需要安装）。

更一般地说，CRAN HPC 任务视图是这类包的有用列表。

于 2013-03-19T19:47:53.420 回答
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为了在 R 中进行并行计算，有几个包

看看这个PDF：充分利用你的 CPU 并行计算策略在 R

这里有一个网站High-Performance and Parallel Computing with R报告了几个关于 R 中并行计算的包

于 2013-03-19T19:47:46.843 回答