python - 在 Python 中计算 Fisher 标准

Question

是否有一个python模块，当给定两个向量x和y时，其中y是一个二类（0,1），它计算Fisher标准，如这里的公式所示http://compbio.soe.ucsc.edu /genex/genexTR2html/node12.html

请注意，我不打算应用Fisher 的线性判别式，只应用Fisher 标准:)。

提前致谢！

Answer 1

据我所知，你可以自己写（请测试这个结果是否正确，我只是根据我对公式的理解）。

import numpy as np

def fisher_criterion(v1, v2):
    return abs(np.mean(v1) - np.mean(v2)) / (np.var(v1) + np.var(v2))

例如，这给出了

>>> fisher_criterion([0, 1, 2], [0, 1])
0.54545454545454553

Answer 2

这看起来非常像线性判别分析- 如果您对此感到满意，那么您可以充分满足scikit-learn和mlpy或众多 SVM 软件包之一的需求。