r - R：对 2 个数据帧的行进行 t 测试

Question

我有两个数据框，我想对行进行独立的 2 组 t 检验（即 dataframe1 中的行在哪里，并且与 dataframe2 中的行t.test(y1, y2)匹配）y1y2

实现这一目标的最佳方法是什么？

编辑：我刚刚找到了格式：dataframe1[i,] dataframe2[i,]。这将循环工作。这是最好的解决方案吗？

Answer 1

您概述的方法是合理的，只需确保预先分配您的存储向量。我会仔细检查您是否真的想比较行而不是列。我使用的大多数数据集都将每一行作为一个观察单位，并且这些列代表不同的响应/感兴趣的列无论如何，这是您的数据 - 所以如果这是您需要做的，这里有一种方法：

#Fake data
df1 <- data.frame(matrix(runif(100),10))
df2 <- data.frame(matrix(runif(100),10))


#Preallocate results
testresults <- vector("list", nrow(df1))
#For loop
for (j in seq(nrow(df1))){
  testresults[[j]] <- t.test(df1[j,], df2[j,])
}

您现在有一个列表，只要您在df1. 然后，我建议使用lapply并sapply轻松地从列表对象中提取内容。

Answer 2

将数据存储为列会更有意义。

您可以通过以下方式转置 data.frame

df1_t <- as.data.frame(t(df1))
df2_t <- as.data.frame(t(df2))

然后您可以使用一次mapply循环通过两个data.frames列

t.test_results <- mapply(t.test, x= df1_t, y = df2_t, SIMPLIFY = F)

或者您可以使用它是with Map的简单包装器（从而节省击键！）mapplySIMPLIFY = F

t.test_results <- Map(t.test, x = df1_t, y = df2_t)