我一直在 R 中进行一些数据分析,我试图弄清楚如何将我的数据拟合到 3 参数 Weibull 分布。我找到了如何使用 2 参数 Weibull 来完成它,但是在找到如何使用 3 参数来完成它方面做得很短。
这是我使用包中的fitdistr
函数拟合数据的方法MASS
:
y <- fitdistr(x[[6]], 'weibull')
x[[6]]
是我的数据的一个子集,y 是我存储拟合结果的位置。
我一直在 R 中进行一些数据分析,我试图弄清楚如何将我的数据拟合到 3 参数 Weibull 分布。我找到了如何使用 2 参数 Weibull 来完成它,但是在找到如何使用 3 参数来完成它方面做得很短。
这是我使用包中的fitdistr
函数拟合数据的方法MASS
:
y <- fitdistr(x[[6]], 'weibull')
x[[6]]
是我的数据的一个子集,y 是我存储拟合结果的位置。
首先,您可能想查看FAdist package。rweibull3
但是,从到并不难rweibull
:
> rweibull3
function (n, shape, scale = 1, thres = 0)
thres + rweibull(n, shape, scale)
<environment: namespace:FAdist>
同样从dweibull3
到dweibull
> dweibull3
function (x, shape, scale = 1, thres = 0, log = FALSE)
dweibull(x - thres, shape, scale, log)
<environment: namespace:FAdist>
所以我们有这个
> x <- rweibull3(200, shape = 3, scale = 1, thres = 100)
> fitdistr(x, function(x, shape, scale, thres)
dweibull(x-thres, shape, scale), list(shape = 0.1, scale = 1, thres = 0))
shape scale thres
2.42498383 0.85074556 100.12372297
( 0.26380861) ( 0.07235804) ( 0.06020083)
编辑:如评论中所述,尝试以这种方式拟合分布时会出现各种警告
Error in optim(x = c(60.7075705026659, 60.6300379017397, 60.7669410153573, :
non-finite finite-difference value [3]
There were 20 warnings (use warnings() to see them)
Error in optim(x = c(60.7075705026659, 60.6300379017397, 60.7669410153573, :
L-BFGS-B needs finite values of 'fn'
In dweibull(x, shape, scale, log) : NaNs produced
起初对我来说只是NaNs produced
,这不是我第一次看到它,所以我认为它没有那么有意义,因为估计很好。经过一番搜索,这似乎是一个非常流行的问题,我既找不到原因也找不到解决方案。一种替代方法是使用stats4
包和mle()
函数,但它似乎也有一些问题。但我可以让您使用 danielmedic 的代码修改版本,我已经检查了几次:
thres <- 60
x <- rweibull(200, 3, 1) + thres
EPS = sqrt(.Machine$double.eps) # "epsilon" for very small numbers
llik.weibull <- function(shape, scale, thres, x)
{
sum(dweibull(x - thres, shape, scale, log=T))
}
thetahat.weibull <- function(x)
{
if(any(x <= 0)) stop("x values must be positive")
toptim <- function(theta) -llik.weibull(theta[1], theta[2], theta[3], x)
mu = mean(log(x))
sigma2 = var(log(x))
shape.guess = 1.2 / sqrt(sigma2)
scale.guess = exp(mu + (0.572 / shape.guess))
thres.guess = 1
res = nlminb(c(shape.guess, scale.guess, thres.guess), toptim, lower=EPS)
c(shape=res$par[1], scale=res$par[2], thres=res$par[3])
}
thetahat.weibull(x)
shape scale thres
3.325556 1.021171 59.975470
另一种选择:包“lmom”。L-矩技术估计
library(lmom)
thres <- 60
x <- rweibull(200, 3, 1) + thres
moments = samlmu(x, sort.data = TRUE)
log.moments <- samlmu( log(x), sort.data = TRUE )
weibull_3parml <- pelwei(moments)
weibull_3parml
zeta beta delta
59.993075 1.015128 3.246453
但我不知道如何在这个包或上面的解决方案中做一些拟合优度统计。其他软件包,您可以轻松地进行拟合优度统计。无论如何,您可以使用以下替代方法:ks.test 或 chisq.test