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我有本地数据库驱动的网站，其中包含一些通过其 GI 编号唯一标识的序列。是否可以在给出 GI 的情况下直接链接到“NCBI 爆炸站点”。例如 GI 903049 的序列有这个链接：

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/903049

它链接到这个爆炸页面：

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&QUERY=U22848.1&DATABASE=nr&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&LINK_LOC=nuccore&PAGE_TYPE=BlastSearch

我想直接链接到这个网站而不必去NCBI。谢谢。

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您可以使用 ncbi efetch 下载所有 gis：

http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=903049&rettype=fasta&retmode=text

并运行本地版本的blast：http ://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download

也可以问映泰： http: //www.biostars.org/show/questions/

于 2012-05-09T16:54:26.873 回答