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我有一组n基因组和n相应的适应度值。我想根据它们的比例适应度值对基因组进行替换采样，例如P(genome) = fitness(genome) / sum(fitness(genomes)). Matlab中是否有这样的采样机制？

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如果您想从 4 个群体中获取 10 个样本，其适应度分别为 0.4、0.3、0.2 和 0.1，那么您可以执行以下操作：

>> fitness = [0.4 0.3 0.2 0.1];
>> mnrnd(10,fitness)
ans =
     3     5     1     1
于 2012-04-25T07:51:38.183 回答
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您可以randsample为此目的使用：

>> f = [2 5 7 8 1]; %# fitness values (not normalized)
>> g = {'g1', 'g2', 'g3', 'g4', 'g5'}; %# genome names
>> gSampled = randsample(g,100,true,f) %# sample 100 genomes with replacement
于 2012-04-25T08:13:46.333 回答
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Matlab 内置多项式随机数生成器。您可以将mnrnd其用于您的目的。

于 2012-04-25T00:17:45.727 回答