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qusb 的 -V 选项仅导入环境变量，但不导入 .bashrc 的别名。例如

并且 qsub 脚本是

在这种情况下echo $PYTHONPATH，ls工作正常，但ll会la出错ll: command not found。那么如何在 qsub 中导入别名命令呢？

或者有没有更好的替代方法，alias以便命令（ll或la）表现得像ls并且可以轻松导入

我们使用太阳网格引擎（实际上是开放的调度器网格）作为drms。假设我们有 3 个用户：uA、uB、uC。uA 提交 100000 个工作，然后 uB 提交 10 个工作，然后 uC 提交 1 个工作。在默认的调度策略下，Grid Engine 会运行 uA 的 100000 个作业，然后是 uB 的 10 个，然后是 uC 的 1 个作业，因此 uB 和 uC 需要等待很长时间。

我们希望调度器可以像这样选择要运行的作业：

首先，选择1 uA的工作，1 uB的工作，1 uC的工作

然后，选择 19 uA 的工作，19 uB 的工作

然后，选择uA的其他工作

如何设置适合此的策略？

qsub假设我们在 path 下提交作业/path/to/working/dir，在作业挂起后，我们可以获得作业的一些信息qstat，但没有提供工作目录信息qstat。

我们怎样才能得到这个？

我有一个关于 vmem 和 maxvmem 的问题。我在网上搜索过，但对这两个词的解释确实很混乱。我所做的是输入：

qstat -j 1154926 | grep vmem

输出为：cpu=00:05:25, mem=23.21121 GBs, io=2.70481, vmem=239.277M, maxvmem=351.359M

谁能帮我理解变量的含义？

最好的

我在生成大型日志文件的 Sun Grid Engine 批处理系统中运行代码。我可以使用 -o 和 -e 选项选择输出位置，但想知道我是否可以告诉它根本不记录输出。

我们使用gridengine（完全开放的grid scheduler 2011.11.p1）作为批处理系统。刚才我添加了一个名为 execd 的主机host094，但是当在那里提交作业时，发出错误，作业状态为Eqw，登录$SGE_ROOT/default/spool/host094/messages说：

什么意思？

我通过 qrsh 调用在现场实例上使用 OGS。为了让我的程序正常工作，我需要能够知道作业何时因系统关闭而失败（我失去了现场实例）。

如果我们通过 ssh 执行远程命令并且远程系统出现故障，则返回的退出代码为 255。

我的问题是，对于 OGS，当使用 qrsh 执行远程命令并且远程系统出现故障时，返回的退出代码为 0。0 表示“好的，一切都好”。因此，无法从该代码中知道不，这不好，我需要重新安排。

（当然，我可以更改远程调用以返回特定代码，但由于它不是标准的，我宁愿避免这样做。）

我正在运行一个程序，它被分段错误中断。问题是创建了核心转储文件，但大小为零。

您是否听说过这样的案例以及如何解决？

我有足够的磁盘空间。我已经ulimit -c unlimited对核心文件的大小进行了限制——无论是运行它还是放在提交的批处理文件的顶部——但仍然有 0 字节的核心转储文件。包含这些文件的文件夹的权限为 uog+rw，而创建的核心文件的权限仅为 u+rw。

该程序由 C++ 编写并使用 Grid Engine 的 qsub 命令在 linux 集群上提交，我不知道这些信息与这个问题是否相关。

我有一个运行 samtools mpileup 的简短 bash 脚本。它在本地运行良好，但是当我尝试在 SGE 上运行它时，我收到“非法变量名”反馈。

SGE 变量语法与 bash 不同吗？

我正在尝试运行在集群（SGE）中使用sqlite3的脚本。

该脚本使用 lockfile 创建一个锁，填充数据库并释放锁。

/commun/data/ 从所有节点都可见。/commun/data/_tmp.idp448.lock 是我创建的一个随机名称，我目前是唯一使用我们新集群的人。

没有 qsub 脚本可以正常工作：

当qsub被调用时：

这是一个 sqlite3 错误。

您有什么想法或建议，在 SGE 方面，可能是导致该问题的原因，即这种行为差异？

谢谢皮埃尔

更新：

我在集群的一个节点上以 root 身份登录。以下简单命令失败：（/commun/data/stats2.sqlite 不存在）

它在 ~root 中工作：